据龙门洞史料记载，龙门洞始于春秋，建于西汉，盛于金元。相传西周（今河南灵宝市函谷关镇）函谷关令尹喜，以桔草为楼，助老子作《道德经》五千言后，弃职归山，隐居这里，始名灵仙岩。战国时，这里又易名都潭洞。西汉景文帝之时，曾任皇帝侍郎官的建信侯娄景弃官入道，晚年隐居修行此地更名景福山。唐代医学家孙思邈辞诏不受，隐居龙门太玄洞，采药行医，悬壶济世。金元时期，道教“七真人”之马丹阳、丘处机在此修炼传道。丘处机在此修行七载，改山名为龙门洞，创立了道教龙门派，成为中国道教史上成就最大的全真高道。丘处机因受南宋、金、元三个王朝尊崇，先后多次受到金世宗和元太祖召见，被成吉思汗策封为国师，执掌全国道教，龙门洞自此声名大振，步入辉煌，誉满神州，达到鼎盛。其门徒依山从水，借景取势，修宫建庙，宏大山门，扩张规模。此后龙门洞历经包括杨虎城、孙蔚如等一批军政要人和善男信女的修葺扩建，又屡遭兵火劫焚，最终形成了今天风貌。

丘处机金大宝元年（1166年）19岁时出家昆仑山，次年从师全真教创始人王重阳潜心钻研道家经典。后居蟠溪六年，32岁时栖居龙门洞，7年苦心修道，创立了自成体系的道教龙门派，成为中国道教历史上的一个重要里程碑。丘处机三受金世宗召见，朝廷赐其衣冠道服，受命住于天长观，授其“自然应化弘教大师，”从此声震朝野。73岁高龄时，他接受元太祖成吉思汗的召见，率18名弟子从山东莱州启程，历经艰险，竭见成吉思汗，向其阐述“修身养命，治国安邦”之道，创造了“万里赴诏，一言止杀”的人间神话。被元世祖赐住长春宫，被封为“长春演道主教真人，授予金虎牌，诏令全国出家道士统归丘处机管理，从而成为道教教皇。“万古长生不用餐霞求秘诀，一言止杀始知济世有奇功”清乾隆皇帝用楹联精辟地概括了这一史实。道教龙门派的祖庭。