龙门洞时道教龙门派的发祥地，因而作为龙门道院山场的殿阁庙宇修建及庙宇内诸神的供置祀奉和信仰活动的全部，无一不把老子作为祖师而尊崇，无一不把清静无为、修真养性作为信仰的主旨，无一不把开山祖师作为尊崇的核心而施行。这也构成了龙门洞景区静谧秀丽，超然物外 ，与世无争的氛围和独特景观风格。

北极宫 为龙门道院主殿，坐洞面西，由后山根蹑云桥起登153级石蹬即至。明末清初所建，为道院最大的殿堂，肃穆庄严，气势宏伟。殿中央供奉玄天上帝真武祖师金身坐像，西边陪祀四大帅神站像，威武庄严。并书有：“一剑镇乾坤盛德广庥赤子，四门怜苦恼宏恩大度苍生”楹联1幅。龛台上供有清代铁铸昊天玉皇大帝坐像，高1米，重约25公斤，头戴王冠，身着蟒袍玉带，面形丰满。另有檀木雕刻的无量祖师坐像，高约1米，雕刻精细。殿内幢、幡、宝盖、经籍。钟鼓等道家法器俱全，斋醮诵经均于此处举行。木架上悬有云板形法石1块，重约15公斤，用物敲击，声如钟磬，远处可闻，为汉代物，具文物价值。殿内还置有高1米的三足铁香炉1座。殿内两旁有清代陇州同知方玉润所书木刻楹联：“洞天标胜景混元有始日月无终自昔山林栖凤爪，福地溯仙踪娄景开先长春启后于今道派衍龙门”。此联尽善尽美的阐述了龙门洞的人文历史。因系主殿，香汛期香火最盛。

邱祖楼 亦名清和宫、七真楼，位于北极宫东侧。楼3间，结构精巧，经过装修，飞阁流丹，典雅肃穆。旧时楼内塑有全真教马丹阳、谭处端、刘处玄、丘长春、王钰阳、郝大通。孙不二七真人的坐像，现改塑为长春真人丘处机像。过去曾将邱祖的遗物皆藏于此，今已佚失。丘祖曾以芭蕉诗赞咏此处景观：“一叶青片仰掌开，三湫白浪散花回，日中有客频来赏，月下无人独自陪，造化乾坤难比大，寻常风雨莫教摧，留君日日当金案，与客时时庆玉杯。”后又有信徒为此楼题萦联赞邱祖曰：“遁迹龙门，光射北斗，元帝三迎帷幄谈玄求至道；潜修古洞，名闻西域，宰辅九拜燕京立会阐宗风“。现此楼上挂有清人谢威风所书”仙人掌“匾额1块。

灵官楼 位于北极宫对面。为料石砌基、土木结构的层楼建筑。屋脊上座有各种工艺小陶瓦物可供观赏。前檐门窗刻制精细，门上框格内题有“豁落府“3字，殿内左侧祀有”太乙雷声应化天尊“神像。简称灵官尊神，其形态正直威严，故此楼楹联为：”心怀邪鄙，任尔烧香无点益，持身正大，见吾不拜又何妨“。

子孙宫 位于云厨西侧的石嘴上。宫内龛台上供有三尊圣母像，传为周文王之三妻，周文王之百子全赖三母抚育教养，供此寓取“多子宜男“之兆，旁边陪祀有”海龙圣母“像。传”海龙圣母“为灵台县之处女，成道于华亭境内之海龙山，旧时为灵台人多次祈雨得到感应。圣母之灵，扶佑一方，使其风调雨顺，五谷丰登，故民间特别信仰在此宫祈子求雨。昔郑板桥曾为此宫作联云：“凭栏欲笑望当时树拥云飞迥殊尘境，抱子何归趁此日水流花放早降人间。”

太上殿 位于全真岩下，贴岩砌石筑台而建，故显耸巍庄严。殿为三楹，内祀道教之祖太上老君（老子）神像。其殿壁上有清道光十三年（1833）根据《老子化胡经》所绘的道教故事壁画81幅。画面为工笔彩绘，勾勒清晰生动，色调朴雅，为道教庙观中少见的艺术珍品，是民间艺术工匠智慧的结晶。画面描绘的“八十一化”所形容的“道”，虽然宗教色彩浓厚，但用古代自然主义的朴素唯物论观点，对庙宇的形成，阴阳五行的认识，日月星辰的布局，二十四节气对人类生产生活的关系以及社会进化精神的、物质的方面都作了启蒙式的诠释；以无名天地之始，有名万物之母解释了宇宙万物从无到有这一“道”的准则。进而用以教化人们以无为观察一切，对待一切。同时，从该殿的几幅楹联还可对其加以证明：“多看经书开智慧，少谈是非养精神”；“天下第一件要事还是修真，世上几千年名教无非玄德。”

太白殿 悬建于太上殿右后侧石壁上，上石蹬数阶至全真岩下，再攀铁链越石可至。殿内祀三太白像，即尧（天官）、舜（地官）、禹（水官）三官，旨在祈求风调雨顺，国泰民安。

王母宫 由太白殿西侧悬崖绝壁上下垂的数丈索梯攀登可至，其宫镶嵌在前倾约30度的全真岩凹部，自下仰瞻，朱柱彩檐，流光四射，玲珑悬空，设身处此有天上人间之感。宫内祀有龟台金母神像，传周穆王驭八骏西巡，曾亲谒王母，觞于瑶池。故道教虔诚奉祀，并有“神仙好修，王母难见”之说。

玉皇阁 亦名朝元阁。由太白殿左侧过悬空栈道数丈即至。此阁建在洞内砌筑的石台上，形为木质结构歇山转角，规模虽小，却玲珑别致。内供“玉皇赦罪天尊、玄穹高上帝”神像，其神在道教中所尊崇的是《玉皇心印妙经》，为道教徒养生修持之必修功课，世人称此为养生之最，李时珍曾尊其为“医家真言”，对我国医术及养生学的发展具有重要的促进作用。

三清阁 由玉皇阁右侧循栈道攀爬登数步即至。此阁构思奇特，设计精细。它立柱于岩穴，架楹于崖隙，飞檐斗拱，兽头突兀，亮格门窗，朱红栏杆。凭栏俯视，龙门山场尽收眼底，凝神注思，离尘之感油然而生。阁内神龛供有“元始天尊”、“灵宝天尊”、“道德天尊”三清神像，在道教中三清为至高无上之神。明万历时，三清均为铜像，惜乎皆毁于明末。现为泥塑。

混元阁 亦称混元顶。此为龙门洞的最高处，距道院高约130米，凡来龙门洞者都以能有勇气到此一游为乐，然到此者不多。混元老祖龛洞全用斗拱临空架设，凿壁衬托，十分险峻，可谓神工鬼斧。由太上殿通往此处的栈道长约50米，全在峭壁凿孔，打入铁桩，用木板架桥，垂悬在凌空，游人攀铁索依壁而蹬，往往毛骨悚然。登临此顶，凭栏远眺，关山林海，尽收眼帘；四顾旷杳，白云在握，宛若置身云天，顿生“一览众山小”之感。阁内神龛中供奉的混元老祖，是道教中象征宇宙形成，主宰万物的万能神灵，是“道”的形象化。这一道教神仙谱系体现着道家“一生二，二生三，三生万物”的自然生成理论和中国传统的“天人合一”的哲学思想。
救苦殿 在太白殿下，砌石筑台，殿宇三楹，内祀太乙极苦天尊。其下地势稍缓，有石径通达道院。道中有一泉，深约1米，清彻见底，冬温夏凉，水味甘甜，宜煮茶、煎药，洗浴有明目功效，俗传为马丹阳饮漱之处，世人称为甘露泉。

八卦亭 在救苦殿下，为翘檐八角亭，相传为钟离权。吕洞宾对弈的遗址。亭内奉东王宫神位。

药王殿 在八卦亭下，为近年重修。台基为料石砌成方台，上建殿宇，为歇山式三转五台榭式三面走廊建筑，环以树林。内祀药王孙思邈塑像，陪祀龙王、敬德。因传说孙思邈曾于陇山采药，龙门山有其晒药遗址。

黑虎殿 在子孙宫下、由谷底登山半途的小阶地上，又名黑虎台。上建一砖木殿堂，内祀黑虎灵官。殿外平台可供登山游人小息观览，在阶沿处俯览早阳洞最为真切。

二郎庙 在蹑云桥东侧10米高的悬崖上，依崖而建一间露天殿堂，内祀二郎神。传说二郎神为龙门山守护之神，故立祠桥头，守护山门。由蹑云桥至二郎庙，崖际垂有铁索，需攀援而上。

八仙楼 在道院东约百米的偏上处，亦可由药王殿向东穿林而至。楼为砖木结构的两层三间建筑。上层内奉东华帝君和八仙，两侧陪祀娄景、张三丰。下层为四公祠，祀清初重建龙门的四位开山祖师，即曾守云、黄本善、苗清杨、田守存。楼前为二间卷棚，棚内外现存碑石5通，其中棚内所立汉白玉“陇州龙门洞景福山玉宸宫碑记”碑，为元至元十六年（1279）所立，是龙门洞现存最早的碑石，具文物价值。棚内有残缺壁画，外侧有二株同龄柏树，传系丘处机手植，楼后有八仙洞。

云厨 在七真楼西侧，为三间平房，用作道院的厨房。房檐下挂铁制云板（作钟用），为召集道众用餐的器物。龙门洞道院属素山，云厨只供素斋，严谨荤腥。要求道俗共同信守云厨道规，故云厨门上常写的对联有“勺水共饮蓬莱苑，粒米同餐羽士家”，“休嫌浆水淡须知淡中有味，莫道菜根苦要在苦中求甜”等等。